Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms