Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1lQ3TTP0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1lQ3TTP0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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