Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd11Q1RNF8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms