Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrioQ0KL02 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TrioQ0KL02 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms