Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ythdf1P59326 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms