Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX1P48742 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX1P48742 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX1P48742 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX1P48742 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms