Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TnfP06804 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnfP06804 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnfP06804 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnfP06804 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnfP06804 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnfP06804 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnfP06804 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnfP06804 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnfP06804 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnfP06804 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnfP06804 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnfP06804 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnfP06804 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnfP06804 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnfP06804 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnfP06804 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnfP06804 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnfP06804 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnfP06804 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnfP06804 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnfP06804 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TnfP06804 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TnfP06804 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TnfP06804 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TnfP06804 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TnfP06804 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TnfP06804 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TnfP06804 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TnfP06804 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TnfP06804 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TnfP06804 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TnfP06804 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TnfP06804 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TnfP06804 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TnfP06804 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TnfP06804 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TnfP06804 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TnfP06804 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TnfP06804 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TnfP06804 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TnfP06804 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TnfP06804 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TnfP06804 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TnfP06804 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TnfP06804 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TnfP06804 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnfP06804 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TnfP06804 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnfP06804 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms