Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms