Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms