Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CDO00329 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms