Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl41A2AUC9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl41A2AUC9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms