Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shcbp1Q9Z179 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms