Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms