Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms