Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms