Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRMS1Q9HCU9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms