Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P0

Mrpl13, 39S ribosomal protein L13, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl13Q9D1P0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl13Q9D1P0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms