Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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