Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC2Q9C0B9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms