Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms