Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms