Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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