Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf6Q62311 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms