Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms