Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf149Q3U2C5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms