Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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