Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A3Q14050 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A3Q14050 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms