Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRJQ12913 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
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PTPRJQ12913 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRJQ12913 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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