Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK3Q00526 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms