Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms