Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt2P50752 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms