Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD34P28906 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD34P28906 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD34P28906 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms