Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms