Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA6AP0CW24 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms