Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt1P04104 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms