Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTNP04004 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VTNP04004 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VTNP04004 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VTNP04004 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTNP04004 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTNP04004 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTNP04004 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTNP04004 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VTNP04004 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTNP04004 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTNP04004 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VTNP04004 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTNP04004 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTNP04004 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTNP04004 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTNP04004 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTNP04004 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTNP04004 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTNP04004 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTNP04004 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTNP04004 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms