Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms