Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms