Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim15G3UY57 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms