Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms