Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP20Q9Y2K6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms