Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms