Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps29Q9QZ88 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms