Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
KLHL42Q9P2K6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms