Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms