Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms