Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap3m1Q9JKC8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms