Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms