Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Erp27Q9D8U3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Erp27Q9D8U3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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