Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arpc5lQ9D898 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms